液相色譜柱是運用于色譜儀系統中起著分離作用的儀器，是色譜儀分析系統的核心部件，色譜柱柱效的高低影響著檢測速率的快慢以及檢測結果的準確性。對色譜柱的要求是柱效高、選擇性好，分析速度快。色譜柱的性質（粒度、粒徑分布等）、填充料、柱長、固定相和流動相的種類等都是影響色譜柱柱效的因素。因此，為了提高色譜柱的柱效，保證液相色譜儀分析檢測的靈敏性，了解液相色譜柱的結構性能尤為重要。
　　
　　液相色譜柱通常分為正相柱和反相柱。正相柱大多以硅膠為柱，或是在硅膠表面鍵合-CN,-NH3等官能團的鍵合相硅膠柱;反相柱填料主要以硅膠為基質，在其表面鍵合非極性的十八烷基官能團（ODS）稱為C18柱，其它常用的反相柱還有C8,C4,C2和苯基柱等。另外還有離子交換柱，GPC柱，聚合物填料柱等。
　　
　　正相色譜柱的使用方法
　　
　　1.新柱子可直接用流動相。推薦先用正己烷-乙腈（99：1）以0.5ml/min的流速沖10倍柱體積，再根據流動相選用極性相近的氯仿或二氯甲烷以相同的流速沖10倍柱體積，zui后換成流動相；
　　
　　2.正相使用時，不宜分析含醛基、羰基的化合物，不可用于還原糖的分析；流動相要*脫氣，并不得含有羰基化合物和過氧化物（質量不好的乙醚、*含有少量）；
　　
　　3.任何時候更換流動相時都要確保新流動相與柱子原保存液可互溶。
　　
　　反相色譜柱的使用方法
　　
　　1.先用正己烷-乙腈（99：1）以0.5ml/min的流速沖10倍柱體積，再依次以相同的流速相同的用量用氯仿、異丙醇、甲醇、甲醇-水（50：50）沖柱子；
　　
　　2.以0.5ml/min的流速用30倍柱體積的pH11.0的*（LUNA）水溶液沖柱子（注意pH值切不可超過11.0），立即用水（0.5ml/min的流速，30倍柱體積）沖洗，再換成流動相；
　　
　　3.配制流動相時，應各組分分別量取，比例較小的組分要精密量取，需調pH值時要精密到0.1；
　　
　　4.反相條件下使用時，要特別注意控制pH值范圍，pH值越低越有發生水解的危險，流動相中水的比例越高當然也越有發生水解的危險。的pH范圍在pH3.0-7.0；
　　
　　5.如果要使用的流動相中還含有緩沖鹽類，建議在用分析流動相之前，先用不含緩沖鹽的同比例流動相過渡，這樣可避免緩沖鹽在分析柱內的析出。